M13和其它的丝状噬菌体载体，在文库构建和为序列测序提供单链DNA和引入突变方面十分有用。将适量M13丝状噬菌体或者相关噬粒（M13来源）感染的液体培养物离心，得到上清中的单链噬菌体DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜上，再通过一系列快速的漂洗－离心的步骤，将盐、细胞代谢物，蛋白等杂质去除，最后低盐的洗脱缓冲液将纯净噬菌体单链DNA从硅基质膜上洗脱。